Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms