Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RABGEF1Q9UJ41 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms