Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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