Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6BQ9NRW1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms