Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CIPCQ9C0C6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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