Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms