Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVK-6Q9BXR3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVK-6Q9BXR3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms