Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms