Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NDFIP1Q9BT67 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms