Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms