Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms