Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKD2Q969F2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms