Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG4Q92954 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms