Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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COPS9Q8WXC6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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