Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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NUP35Q8NFH5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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NUP35Q8NFH5 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NUP35Q8NFH5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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