Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TRAPPC6BQ86SZ2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TRAPPC6BQ86SZ2 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TRAPPC6BQ86SZ2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TRAPPC6BQ86SZ2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TRAPPC6BQ86SZ2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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