Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HRCT1Q6UXD1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms