Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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