Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF549Q6P9A3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms