Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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LRRC38Q5VT99 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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LRRC38Q5VT99 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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LRRC38Q5VT99 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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LRRC38Q5VT99 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC38Q5VT99 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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