Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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COL5A1-AS1Q5SY13 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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COL5A1-AS1Q5SY13 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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COL5A1-AS1Q5SY13 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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COL5A1-AS1Q5SY13 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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COL5A1-AS1Q5SY13 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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COL5A1-AS1Q5SY13 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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COL5A1-AS1Q5SY13 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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COL5A1-AS1Q5SY13 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
COL5A1-AS1Q5SY13 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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