Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms