Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA3Q53S33 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA3Q53S33 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA3Q53S33 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA3Q53S33 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA3Q53S33 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA3Q53S33 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BOLA3Q53S33 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BOLA3Q53S33 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms