Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

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Length 1,214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBPF1Q3BBV0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBPF1Q3BBV0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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