Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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