Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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