Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SSX1Q16384 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms