Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DDX39BQ13838 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DDX39BQ13838 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DDX39BQ13838 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DDX39BQ13838 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DDX39BQ13838 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DDX39BQ13838 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DDX39BQ13838 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DDX39BQ13838 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DDX39BQ13838 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DDX39BQ13838 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DDX39BQ13838 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DDX39BQ13838 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
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DDX39BQ13838 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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DDX39BQ13838 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
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DDX39BQ13838 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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DDX39BQ13838 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DDX39BQ13838 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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DDX39BQ13838 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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DDX39BQ13838 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DDX39BQ13838 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DDX39BQ13838 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DDX39BQ13838 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DDX39BQ13838 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DDX39BQ13838 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DDX39BQ13838 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DDX39BQ13838 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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DDX39BQ13838 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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DDX39BQ13838 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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DDX39BQ13838 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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DDX39BQ13838 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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DDX39BQ13838 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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DDX39BQ13838 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DDX39BQ13838 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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