Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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