Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 415.7 ms