Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A2Q05940 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms