Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms