Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CRIP1P50238 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms