Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNTAP49354 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTAP49354 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTAP49354 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms