Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNPDA1P46926 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms