Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A2P43004 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms