Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GJC1P36383 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GJC1P36383 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms