Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms