Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms