Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMBRP28336 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMBRP28336 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms