Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PEX2P28328 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PEX2P28328 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms