Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB4P28070 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms