Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNA2P26232 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms