Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms