Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTGS1P23219 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms