Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XPAP23025 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
XPAP23025 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XPAP23025 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XPAP23025 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XPAP23025 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms