Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC9A1P19634 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms