Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT4P19013 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT4P19013 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT4P19013 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT4P19013 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT4P19013 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT4P19013 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT4P19013 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT4P19013 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT4P19013 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT4P19013 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT4P19013 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT4P19013 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT4P19013 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT4P19013 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT4P19013 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT4P19013 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT4P19013 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms