Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKMT2P17540 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms