Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms